2011年4月11日，清華大學校內，一些學生穿上軍裝在午后練習踢正步，為即將到來的校慶慶典做準備。
“現在就是清華最好的時候！”方惠堅認為，無論是社會環境、政府支持力度，還是學生素質、師資力量、科研水平方面，清華都面臨最好的機遇。他也認為，清華校內一直不乏有思想、有才華的教授，而作為清華的領導者，最應該做的就是提供一個寬松的氛圍，充分發揮教授們的積極性。
還有人想得更深更遠。王鐵藩就表示，最近這些年來，老清華與新清華有了相互貫通融合的跡象，老校訓“自強不息，厚德載物” 被重新啟用，“人文日新”日益被張揚，不僅“理工合校”而且“文理薈萃”了，甚而在校園道路的命名中，也起用了諸如“明德”“新民”“至善”這些出自梅貽琦之口并帶有中國傳統哲學意味的詞匯。但是，也有一些新舊思想依然糾結沖突，比如先前的“獨立之精神”“自由之思想”和后來的“又紅又專”“聽話出活”依舊沒有找到對接之處……
對此，朱邦芬認為，清華現在的人文精神有進步，但還不盡如人意。清華過去幾十年的提法“聽話出活”，對人才培養起到的作用，是“成也蕭何，敗也蕭何”。
“一方面，‘聽話出活’有利于行政管理與團隊建設，對于清華畢業生比較好地適應社會、高效率地完成工程項目有幫助，因為絕大多數單位領導喜歡下屬聽話出活。但對于原創性的科學研究，最重要的素質是批判性思維，‘聽話出活’對于創新人才的培養是災難性的。”
2009年，清華大學啟動了一個新的人才培養項目——“清華學堂班”，在數學、物理、計算機、力學、生命科學、化學等6個基礎學科的本科生中，選一批拔尖人才進行因材施教。
據朱邦芬介紹，不同于許多尖子班給學生“開小灶”的做法，“清華學堂物理班”的因材施教不是“教多一些，教深一些，教早一些”，而是給學生減負，讓這些學生有時間按自己的興趣、主動地學習和探索，甚至可以不上一些必修課。“等清華學堂修繕完畢后，這幾個班的學生將一同聚在那里上課。屆時，不同專業的學生在一起可以進行思想的交流和碰撞，就像清華學堂時期那樣。” （記者/錢煒）
